Shana, Alastor dan Lord dari Realm Crimson, terus melakukan pertempuran dengan Denizen, yang mencoba untuk mencuri Kekuatan dari Keberadaan manusia.

Dalam pertempuran terakhir, Yuji diturunkan menjadi Mystes, sebuah “obor” yang memiliki kekuatan hampir tak terbatas.

Karena Denizen ingin menangkap Yuji dan menggunakan dia untuk mengganggu keseimbangan Realm, Shana memutuskan untuk melindungi Yuji. Yuji kemudian bersumpah untuk bergabung bersama Shana dalam perjuangannya.